溪荪溪荪多年生草本植物。根状茎粗壮，斜伸，残留老叶叶鞘纤维;具多数灰白色须根。叶宽线形，长20-70厘米，宽0.5-1.5厘米，基部鞘状，先端渐尖，无明显中脉。
花茎高40-50厘米，实心，具1-2枚茎生叶;苞片3，披针形，长约7厘米，绿色，膜质，先端渐尖;花2-3朵，蓝色，直径6-7厘米，花被管长约1厘米，花被片6，2轮排列，外花被片倒卵形，长约5厘米，宽约1厘米，基部有黑褐色的网纹及黄色斑纹，爪部楔形，无附属物，内花被裂片3，狭倒卵形，长约4厘米，宽约1.5厘米;雄蕊长约3厘米，花丝白色，具黄色花药，花柱分枝扁平，花瓣状，长约3.5厘米，先端裂片三角形，有细齿;子房三棱状柱形。
蒴果三棱状圆柱形，长3.5厘米，直径1-1.5厘米，具6条纵肋，熟时由顶部开裂，花期6-7月，果期7-9月。